Contribution à l’étude de la structuration génétique et la capacité vectorielle des populations de Simulium damnosum s.l à l’aide de marqueurs microsatellites dans trois faciès épidémiologiques de l’onchocercose en Côte d’Ivoire

Résumé

En Afrique de l’Ouest, Onchocerca volvulus, l’agent responsable de l’onchocercose chez l’homme, est transmis par des espèces du complexe Simulium damnosum s.l. Cependant la variabilité génétique intra-spécifique et ses conséquences sur la capacité vectorielle ont été peu étudiées en Côte d’Ivoire. Cette étude décrit l’utilisation des marqueurs microsatellites pour évaluer les flux géniques entre populations de trois différents faciès épidémiologiques de l’Ouest de la Côte d’Ivoire et étudier la structure génétique des populations de S. damnosum s.l, au regard des changements climatiques et environnementaux. Les villes de Soubré situé au Sud-Ouest, Bouaflé au Centre-Ouest et Touba au Nord-Ouest de la Côte d’Ivoire ont été les zones de collecte des simulies en vue des études génétiques. Les mouches ont été capturées sur appât humain de 7h 00 à 18h 00 pendant trois jours consécutifs de décembre 2016 à octobre 2017. Quatre (04) marqueurs microsatellites ont été utilisés pour caractériser les individus des trois populations. Les quatre loci se sont révélés polymorphes avec en moyenne 9 allèles par locus. Deux allèles spécifiques, 190 pb et 290 pb, se sont révélés abondants avec des fréquences respectives de 0,46 % et 0,58 %. Les analyses génétiques révèlent un écart significatif à la proportion de Hardy-Weinberg, un déficit significatif en hétérozygotes et une faible différenciation génétique (FST = 0,046 , P = 0,024) ont été observés pour toutes les populations. La grande variabilité interspécifique serait une caractéristique générale de S. damnosum s.l. Cependant, la classification hiérarchique basée sur la similarité des allèles a montré trois groupes génétiques constitués chacun d’individus issus des trois populations. Par conséquent, ces résultats suggèrent qu’aucune barrière n’existe entre les populations de simulies sur ces trois sites. Cette étude a montré que les loci donnent une estimation indépendante des paramètres génétiques. Le locus H3-4 contribue à la différentiation génétique entre les populations.

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