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Bioinformatic workflow for the analysis of SARS-CoV-2 Spike sequencing raw data from wastewater v1

Article scientifique 2023 Anglais

Résumé

This protocol describes the bioinformatics procedure to analyse SARS-CoV-2 Spike Illumina sequencing data from wastewater. This workflow can be applied to other sequencing datasets to generate high-quality map to reference results.

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Reis, A., Pinto, D., Cunha, M. (2023). Bioinformatic workflow for the analysis of SARS-CoV-2 Spike sequencing raw data from wastewater v1. https://doi.org/10.17504/protocols.io.4r3l2244xl1y/v1

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Auteur(s)

Ana C. Reis Daniela Pinto Mónica V. Cunha

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