Évaluation des facteurs de risques de bio contamination par Salmonella et Escherichia coli virulents de la chaîne alimentaire des légumes à Abidjan (Côte d’Ivoire)

Résumé

Thèse unique de Doctorat xxix L’objectif de cette étude est de contribuer à minimiser le risque d’intoxication lié à la consommation des salades de légumes servies en restauration collective à Abidjan, en évaluant les facteurs de risque de biocontamination de la chaîne alimentaire par Salmonella et Escherichia coli virulents. Une enquête a été effectuée auprès de 330 producteurs et vendeurs et 500 consommateurs. Un total de 552 échantillons de légumes et salades de légume a été l’objet d’analyse microbiologique qui a consisté en un isolement et une identification de Escherichia coli et de Salmonella. La confirmation de l’identification a été effectuée par la détection des gènes iudA et RNA 16S. Les gènes de virulence ont été détectés chez E. coli et les souches de Salmonella ont été sérotypées. Les profils et supports d’antibiorésistance ont été déterminés pour l’ensemble des souches de Salmonella et de E. coli présentant des facteurs de virulence. La probabilité de consommer des salades contaminées par ces germes a été estimée et des mesures de maîtrise sanitaires du risque ont été proposées. Le taux de consommation des salades en restauration collective était de 38,6%. La qualité microbiologique des denrées était non satisfaisante pour 42,7% des légumes et 61,7% des salades de légume. La diversité et la prévalence des pathovars détectées respectivement dans les légumes et salades de légume étaient ETEC (17,1% et 35,3%), EAEC (12,2% et 20,6%), EPEC (2,0% et 7,5%) et STEC (1,6% et 4,9%). La prévalence de Salmonella dans les légumes et salades de légumes était de 8,5% et 2,6%. La prévalence de E. coli virulents et Salmonella résistants aux antibiotiques était respectivement de 11,3% et 15,4% et de 6,9% et 1,0%. L’antibiorésistance concernait plus largement la tétracycline (40-62,5%) et la streptomycine (22-57,1%). Les gènes aaa [3]-IV, CIMT, QnrA, tetA, tetB, cmlA et cat1 conférant respectivement la résistance à la gentamicine, à l’ampicilline, aux quinolones, à la tétracycline et au chloramphénicol ont été mis en évidence. La probabilité de consommer des salades contaminées par Salmonella spp. et E. coli virulents était respectivement de 1% et de 13,6%. L’étude montre un risque de consommer des salades contaminées par des Salmonella et E. coli virulents et multi résistants aux antibiotiques. La mise en oeuvre des mesures de maîtrise sanitaire proposées dans l’étude, permettrait de réduire le risque de contamination.

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