Exploration de l’écosystème végétal (Fruits) : Recherche de souches de bactéries lactiques et de levures antagonistes et/ou probiotiques

Résumé

Cette étude est la première dans son genre en Algérie, qui avait pour but d’explorer l’écosystème de fruits typiques récoltés dans la région de la Kabylie, afin de révéler leur richesse en microorganismes d’intérêts probiotiques et/ou bio-conservateurs. Les mûres (Rubus sp.), les figues fraîches (Ficus carica), les figues de Barbarie (Opuntia ficus-indica) et les grenades (Punica granatum) ont été récoltées dans la localité d’Akbou (W. Béjaia). Cent deux isolats dont 85 bactéries lactiques (Lactobacillus et Leuconosctoc) et 17 levures (Kluyveromyces, Saccharomyces, Hanseniaspora, Pichia, Meyerozyma, et Candidas) ont été obtenus, purifiés et identifiés par spectrométrie de masse MALDI-TOF. Les 85 isolats de bactéries lactiques ont ensuite été évalués pour leur capacité à persister dans des conditions imitant celles du tractus gastro-intestinal, et les taux de survie obtenus ont été traités statistiquement par l'analyse en composantes principales (ACP). Cette analyse a permis de retenir 26 isolats qui ont fait l’objet d’un typage génétique à l’aide de la technique RAPD-PCR. Sur la base de cette dernière, dix souches de lactobacilles (9 Lactobacillus plantarum et 1 Lactobacillus paracasei) ont été sélectionnées. Après vérification de l’innocuité de ces souches (absence de cytotoxicité et d’hémolyse), leur potentiel probiotique (adhésion aux cellules intestinales Caco-2, activités hypocholestérolémiante, antioxydante, antibactérienne, anti-biofilm et antiadhésive) a été mis en évidence. Ces souches ont montré des taux variables d’adhésion aux cellules intestinales (0,37 à 10,22 %). Lb. plantarum F2 et 2F8 ont particulièrement montré une prometteuse activité hypocholestérolémiante et une importante activité bile salt hydrolase en corrélation avec l'expression des gènes bsh2, bsh3 et bsh4. Une activité antibactérienne, principalement liée à la production d’acide lactique (9,64 à 16,74 g/l), ainsi qu’un fort pouvoir anti-biofilm sur microplaques en polystyrène et antiadhésif sur cellules épithéliales Caco-2 à l’égard de bactéries pathogènes (E. coli, S. aureus et L. monocytogenes) ont été enregistrés. De même, un pouvoir antioxydant a été noté en particulier avec Lactobacillus paracasei FB1. Parallèlement, les 17 isolats de levures identifiés, ont été testés pour leurs activités antibactérienne et hémolytique. Seuls les huit isolats du genre Kluyveromyces ont été révélés antagonistes à l’égard de S. aureus et aucun pouvoir hémolytique n’a été détecté. Ces souches ont montré une bonne tolérance à l’acidité et à la bile, un bon potentiel d’auto-agrégation et d’hydrophobicité. L’ensemble de ces résultats nous permettent d’envisager l’élargissement du criblage des levures appartenant à Klyuveromyces et à Saccharomyces et la possibilité d’usage des souches de lactobacilles, en particulier Lb. plantarum F2 et 2F8 et Lb. paracasei FB1 comme probiotiques chez l’Homme.

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