CARACTERISATION PHENOTYPIQUE ET MOLECULAIRE DE SALMONELLA SP ET ESCHERICHIA COLI ISOLEES CHEZ LES BOVINS DANS LE DISTRICT D'ABIDJAN (CÔTE D'IVOIRE) : IMPACT BIOLOGIQUE DE L'UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES

Résumé

La résistance bactérienne aux antibiotiques est devenue un sujet de préoccupation croissante pour le grand public et fait l’objet d’un intérêt scientifique accru. L’objectif général de ce travail est d’étudier l’impact des traitements antibiotique chez l’animal sur l’antibiorésistance des bactéries pathogènes humaine. Pour cette étude une enquête transversale a été menée dans les fermes et parcs à bétail de cinq localités du district d’Abidjan (Port-Bouët, Yopougon, Adjamé, Abobo et Bingerville) avant les différents prélèvements. Les souches de Salmonella et E. coli BLSE ont été isolées des différents prélèvements de bouses fraîches de bovin respectivement sur les milieux Hektoen et Rapid E. coli 2 contenant 2mg/L de Ceftazidime. Un test de sensibilité aux antibiotiques a permis de déterminer les profils de résistances des souches isolées. La recherche des différents gènes de résistances aux antibiotiques et de virulences a été réalisée par la technique de PCR. Les résultats de l’enquête ont montré une forte utilisation de la tétracycline dans les élevages. Aussi, sur un total de 420 échantillons de bouses analysés, les souches de Salmonella et E. coli BLSE ont été isolées avec des proportion respectives de 20% et 20,2%. Le profil de résistance des souches de Salmonella a montré des niveaux résistances relativement élevés à la tétracycline, à la minocycline et à la colistine avec des taux variant de 20,2% à 33,3%. Cependant, de faibles niveaux de résistance ont été observés aux β-lactamines, aux aminosides, aux fluoroquinolones et aux triméthoprime/sulfaméthoxazole avec des taux de résistances variant de 1,2% à 6%. En ce qui concerne les souches de E. coli, elles ont présenté dans l’ensemble des taux de résistances élevés à la colistine, aux triméthoprime/sulfaméthoxazole, aux cyclines et aux β-lactamines et ont varié de 58,8% à 97,6%. Par contre, des taux de résistances relativement faibles ont été observé aux aminosides, aux phénicols et aux fluoroquinolones et ont varié de 7,1% à 34,1%. La recherche des gènes de résistance par PCR réalisée sur 26 souches de Salmonella et 15 souches de E. coli BLSE a révélé, chez Salmonella la présence de gène blaSHV (7,7%), blaTEM, (57,7%), qnrB (30,8%), qnrS (7,7%) et tetA (7,6%). Concernant les souches de E. coli BLSE, la PCR a révélé la présence de gènes blaCTX (73,3%), blaSHV (66,7%), blaTEM (100%), qnrA(100%), qnrB (93,3%), qnrS (60%) et tetA (66,7%). Par ailleurs, aucun gène blaCTX et qnrA n’a été détecté chez les souches de Salmonella. La recherche des gènes de virulence par PCR a montré que ces souches possèdent au moins un gène de virulence. Chez les Salmonella les gènes invA, spvC et iroN ont été détectés respectivement à 100%, 3,9% et 53,9%. Quant aux souches de E. coli BLSE, les gènes stx1, stx2, eae, sta et lt ont été détectés respectivement à 40%, 60%, 86,7%, 2% et 13,3%. Les mauvaises pratiques de l’antibiothérapie dans les élevages contribuent à la dissémination des bactéries potentiellement pathogènes et résistantes aux antibiotiques au sein de la population humaine. D’où la nécessité de mettre en place un bon plan de surveillance des antibiotiques dans les élevages.

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