DIVERSITE GENETIQUE ET EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DE LA CHIMIORESISTANCE DE Plasmodium falciparum CHEZ LES PORTEURS ASYMPTOMATIQUES ET SYMPTOMATIQUES DANS DIFFERENTS FACIES DE LA CÔTE D’IVOIRE

Résumé

Malgré les progrès considérables accomplis dans la lutte contre le paludisme, l’émergence et l’extension de la chimiorésistance aux médicaments antipaludiques utilisés constituent un obstacle à l’élimination de cette maladie. Dans ce contexte, il importe de mettre en place un système de détection précoce, par les marqueurs moléculaires, des isolats chimiorésistants afin d’adopter des stratégies de prise en charge efficace. De plus, une élimination réussie du paludisme à Plasmodium falciparum recommande que l’on tienne compte de tous les porteurs de parasites. Ce travail vise donc à étudier la diversité génétique et l’épidémiologie moléculaire de la chimiorésistance de P. falciparum chez les sujets asymptomatiques versus symptomatiques dans différents faciès épidémiologiques de la Côte d’Ivoire. Il s’est agi d’une étude transversale qui s’est déroulée en saison pluvieuse et en saison sèche de mai 2015 à avril 2016, dans des écoles primaires publiques rurales et urbaines de Grand-Bassam, Abengourou et San Pedro. Dans chaque école, 66 écoliers ont été tirés au sort. Chez chaque écolier, un prélèvement veineux a été effectué au pli du coude pour la réalisation des frottis mixtes et des confettis. Pour effectuer les tests moléculaires, 15 % de cet échantillon ont été tirés au sort. Un diagnostic des espèces plasmodiales a été effectué par la lecture des lames de frottis mixtes. Après l’extraction, de l’ADN plasmodial, un diagnostic moléculaire par Nested PCR a aussi été effectué. La diversité génétique des isolats de P. falciparum a été déterminée avec les gènes pfmsp-1 et pfmsp-2. La détection de la mutation pfcrt K76T a été réalisée par digestion avec l’enzyme Apo1. Les fragments amplifiés du gène K13 ont été séquencés puis analysés en comparaison à la séquence de référence PF_3D7_1343700. Au total, 2 361 échantillons ont été collectés dont 1 190 soit 50,4 % en saison des pluies et 1 171 soit 49,6 % en saison sèche. Il a été noté 17,3 % de sujets symptomatiques, 24,4 % de sujets asymptomatiques et 58,3 % de sujets non infestés par Plasmodium. L’indice plasmodique global est de 41,7 %. P. falciparum a été l’espèce majoritaire dans 91,6 % en monoinfestation, tandis que 0,1 % de P. ovale et P. malariae a été observé. Toutes les familles alléliques pfmsp-1 et pfmsp-2 ont été retrouvées chez tous les types de porteurs, dans toutes les zones d’étude et aux 2 saisons. La complexité de l’infestation a été statistiquement associée à la saison de transmission de P. falciparum et à la localité. Les infections polyclonales ont été significativement liées à la densité parasitaire et à la zone géographique. Aucune association significative n’a été observée entre le statut clinique du sujet et la complexité de l’infection. La fréquence de l’allèle mutant pfcrt 76T a été statistiquement associée à la saison avec une prévalence de 20,5 et 9,1 % respectivement, en saison pluvieuse et en saison sèche (p = 0,0354). Il y a aussi une association significative l’allèle pfcrt 76T avec le site d’étude (p = 0,0111). L’allèle pfcrt 76T n’a pas été associé avec le statut clinique du sujet. Aussi, neuf mutations du gène K13 dont 7 synonymes et 2 non synonymes (Y482H et S522C) ont été détectées. Ces mutations non synonymes ont toutes été trouvées à Abengourou chez les sujets asymptomatiques. Toutefois, les mutations observées ne sont pas celles préalablement décrites dans la résistance aux dérivés de l’artémisinine en Asie du sud-est. En définitive, les génotypes des populations de P. falciparum trouvées chez les sujets asymptomatiques ne sont pas différents de ceux trouvés chez les sujets symptomatiques. Ainsi, malgré leur faible prévalence, les sujets asymptomatiques pourraient nuire aux efforts d’élimination de P. falciparum s’ils ne sont pas pris en compte dans les stratégies de lutte contre le paludisme.

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